科技部３日公布的《“十一五”国际科技合作实施纲要》提出，“十一五”期间，我国国际科技合作将大力促进基础科学与前沿技术的国际合作，在我国具有优势和特色的重点领域取得一批创新成果。
在生命科学领域，合作重点包括生命过程的定量研究与系统整合，重点开展蛋白质的结构与功能、遗传信息的表达与调控、个体发育中的分子与细胞机制、代谢组学等方面的研究等。
在纳米技术领域，合作重点包括纳米加工与纳米器件、纳米材料与纳米结构、纳米医学与纳米生物技术、纳米结构的表征方法与检测、纳米器件与集成的关键方法与技术、纳米体系中的理论和建模问题研究等。
在空天技术领域，合作重点包括航空航天的重大基础科学问题，研究可压缩湍流理论与湍流模型、高速高温气体动力学及真实气体效应等。
在海洋技术领域，合作重点包括深海基因技术、海洋与大气的相互作用等。
在基础学科和科学前沿重大问题领域，合作重点包括加强在数理化等基础学科的国际合作，推动中微子实验等高能物理、凝聚态物质与新效应、物质深层次结构和宇宙大尺度物理学规律、新物质创造与转化的化学过程、核心数学及其交叉领域、脑科学与认知科学等科学前沿技术的国际合作。
在生命科学领域，合作重点包括生命过程的定量研究与系统整合，重点开展蛋白质的结构与功能、遗传信息的表达与调控、个体发育中的分子与细胞机制、代谢组学等方面的研究等。
在纳米技术领域，合作重点包括纳米加工与纳米器件、纳米材料与纳米结构、纳米医学与纳米生物技术、纳米结构的表征方法与检测、纳米器件与集成的关键方法与技术、纳米体系中的理论和建模问题研究等。
在空天技术领域，合作重点包括航空航天的重大基础科学问题，研究可压缩湍流理论与湍流模型、高速高温气体动力学及真实气体效应等。
在海洋技术领域，合作重点包括深海基因技术、海洋与大气的相互作用等。
在基础学科和科学前沿重大问题领域，合作重点包括加强在数理化等基础学科的国际合作，推动中微子实验等高能物理、凝聚态物质与新效应、物质深层次结构和宇宙大尺度物理学规律、新物质创造与转化的化学过程、核心数学及其交叉领域、脑科学与认知科学等科学前沿技术的国际合作。
